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针灸推拿学院·养生康复学院
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人工智能与信息技术学院
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党委办公室、发展委员会办公室
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党委宣传部
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党委教师工作部（与人力资源处合署）
纪委办公室、巡察工作办公室
党委学生工作部、党委人民武装部（与学生工作处合署）
党委研究生工作部（与研究生院合署）
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工会
团委
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教务处（与教学基地办公室合署）
科学技术处
继续教育处（与继续教育学院合署）
财务处
审计处
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实验室与设备管理处
国有资产管理处（与招投标管理服务中心合署）
离退休工作处
研究生院、学科建设办公室
人文与政治教育学院
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图书馆、江苏省中医药博物馆
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图书馆、博物馆
高等教育质量评估和研究中心
网络安全与信息化中心
图书馆（与博物馆合署）
资产经营公司
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第一临床医学院
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养老服务与管理学院
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国际教育学院（与国际合作与交流处合署）
马克思主义学院·医学人文学院
公共外语教学部
体育部
淡安书院
中医药文献研究院（与江苏省中医流派研究院合署）
中药制药过程控制与智能制造技术全国重点实验室
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鼓楼临床医学院
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南方医科大学